为了应对新型基础设施的建设以及潜在的恐怖袭击的威胁，初音湾岸署决定迁入安装了高级安保系统的新栋，初音而主持搬迁工作的则是业已升为刑事课强行犯系系长的青岛俊作（織田裕二 饰）。随着青岛一声令下，全署上下一起行动，此前虽有周密部署，但是难免乱作一团。在此期间，湾岸署辖区内发生了数起奇怪的抢劫案，更令警方汗颜的是，青岛、恩田堇（深津絵里 饰）、王明才（滝藤賢一 饰）的配枪竟在搬迁过程中被人盗出。不久，有人持用他们的配枪无差别杀人，顿令湾岸署陷入最大的危机之中。在此之后，恐怖分子控制了新湾岸署的安保系统，并要求释放包括日向真奈美（小泉今日子 饰）在内的数名重刑犯。青岛该如何面对这次史无前例的大挑战呢？本片为同名电视剧的第3部剧场版。